首先：空氣消毒是作為不同批次間或全群轉出之后的消毒程序當中的最后一步實施的。通常在主要消毒過程完畢、各種可移動設備以及墊料轉進豬舍之后進行。其目的有三：
（1）控制可移動設備和墊料所引進的病原污染。（2）用來對常規消毒無法涉及的部位進行消毒，這些部位可能處于特殊的位置，或離電力設備太近，無法進行常規消毒。（3）有助于減少前面過程產生的塵埃。需要強調的是，空氣消毒是整個消毒程序中的一部分，不能取代常規消毒。
其次：當豬舍里面還畜有豬只的時候，就只能進行空氣消毒。帶豬消毒目的有三：抑制空氣當中病原的傳播；降低塵埃的水平；抑制空氣中的內毒素（特定的細菌產生的毒素，可黏附在塵埃顆粒上，這種毒素對豬群的健康和生產能力有明顯的影響）對豬只造成的影響。
空氣消毒作為用途，可每天進行，甚至更頻繁，能夠取得很好的效果。
